TortoiseMerge는 파일 간의 차이점을 보여줄 뿐만 아니라, 충돌을 해결하거나 변경 사항을 적용할 수도 있습니다.

두 개의 창 보기 상태라면 오른쪽 창(Mine)의 파일만 편집할 수 있습니다. 왼쪽 파일(Theirs)에서 변경된 내용을 적용하려면, 변경된 줄에서 마우스 오른쪽 버튼을 클릭하고 컨텍스트 메뉴 → '상대방 것'에서 텍스트 블록 사용을 선택하세요. 그러면 왼쪽 파일의 변경 사항이 오른쪽 파일에 추가됩니다.

때로는 두 텍스트 블록 모두를 원할 수 있으며, 이 경우 컨텍스트 메뉴에서 컨텍스트 메뉴 → 두 텍스트 블록 모두 사용 (이것 먼저)과 컨텍스트 메뉴 → 두 텍스트 블록 모두 사용 (이것 나중에)을 제공합니다.

텍스트 편집기에서처럼 출력 파일을 편집할 수도 있습니다. 이러한 줄은 연필 아이콘으로 표시됩니다. 위에서 설명한 줄/블록 기반 변경 사항을 적용하려면 먼저 해당 작업을 수행하는 것이 좋습니다. 파일을 직접 편집하기 시작하면 TortoiseMerge가 원본 파일과의 관계를 추적할 수 없게 되기 때문입니다.

세 개의 창 보기(때로는 병합 보기라고도 함) 상태라면 하단 보기(Merged)의 파일만 편집할 수 있습니다. 두 개의 창 보기에서와 마찬가지로 충돌하는 줄에서 마우스 오른쪽 버튼을 클릭하여 컨텍스트 메뉴 → '상대방 것'에서 텍스트 블록 사용 또는 컨텍스트 메뉴 → '내 것'에서 텍스트 블록 사용을 선택할 수 있습니다. 추가로 두 블록 모두를 원한다면 컨텍스트 메뉴 → '내 것'의 텍스트 블록을 '상대방 것'보다 먼저 사용 또는 컨텍스트 메뉴 → '상대방 것'의 텍스트 블록을 '내 것'보다 먼저 사용을 선택할 수 있습니다. 선택한 명령에 따라 변경 사항이 결과 Merged 파일에 적용됩니다.

때로는 Subversion에서 파일이 충돌 상태로 표시되지만, TortoiseMerge로 볼 때는 충돌이 표시되지 않을 수 있습니다. 이는 선택한 공백 처리 방식 때문일 수 있습니다. 줄 끝 또는 공백 변경 사항을 무시하도록 선택한 경우, 해당 줄은 충돌-무시됨 아이콘으로 표시됩니다. 충돌을 해결하려면 여전히 사용할 버전을 선택해야 합니다.